Das Gemeindegebiet Pettendorf gehört zur römisch-katholischen Pfarrei Pettendorf, die daneben noch weitere Ortsteile der Gemeinde Pielenhofen erfasst. Die Kirchen in Pettendorf,
Erstaunlicherweise besteht die 1912 geründete Pfarrei St. Magn heute – mitten in der Großstadt Regensburg – mehr oder weniger aus zwei Inseln, denn durch den Bau des Donaukan